畜禽糞便生產有機肥的主要環節，畜禽糞污被處理時一般呈兩種形態：液態糞便和固體糞便。液態糞便的處理方式有厭氧發酵技術和自然生物處理技術，固體糞便主要處理方式就是堆肥處理。堆肥是指在微生物作用下通過高溫發酵使有機物礦質化、腐殖化、無害化（殺死病原菌、蟲卵、雜草種子等）而變成腐熟肥料的過程。

　　堆肥過程一般來說分為三個環節：1、原料預處理，2、好氧發酵，3、制粒成型

　　原料預處理包括固液分離、輔料粉碎以及對原料含水率、碳氮比、pH值的調整。好氧發酵環節包括翻拋、通風等措施，對原料起到補充氧氣、控制溫度、散發水分和恢復孔隙率的作用。制粒成型是一項系統工程，圍繞制粒成型這一核心，前有粉碎、配料、混合等工序，后有烘干、篩分、冷卻等工序。

　　原料預處理主要是制備滿足好氧發酵要求的發酵原料。其主要過程包括畜禽糞便的固液分離、輔料的粉碎和各種原料的混合配比。好氧發酵是通過有機肥翻拋機進行堆肥發酵腐熟。然后使用有機肥造粒機制粒成型，目前市場上主要的有機肥制粒方法主要有擠壓造粒和團聚造粒。